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按學科劃分可分為:化學實驗室、生物實驗室、物理實驗室。

一、化學實驗室

  化學實驗室主要從事無機化學、有機化學、高分子化學等領域的研究、分析和教學工作。一般包括理化實驗室、精密儀器室、天平室、標液室、藥品室、儲藏室、高溫室、純水室等。

   這主要是進行樣品處理、容量分析、離心、沉淀、過濾等常規實驗和操作或儀器分析等。

二、生物實驗室

  生物實驗室分為動物學實驗室、植物學實驗室和微生物實驗室。

  1、動物學實驗室

  動物學中常見的毒理實驗是從生物醫學角度研究化學物質對生物機體的損害作用及其機制，其實驗室是進行毒性鑒定、安全性評價和功能機制的檢驗和研究的場所，包括普通動物實驗室和潔凈動物實驗室，一般由前區、飼養區、動物實驗室、輔助區組成。

2、植物學實驗室

  植物學實驗室主要進行植物解剖、制片染色、細胞化學成分的測定，微生物檢測、基因的分離純化、體外擴增技術、蛋白質定量測定、電泳分析等試驗

3、微生物實驗室

  微生物實驗室分為病原微生物實驗室和衛生微生物實驗室。

（1）病原微生物實驗室：

  病原微生物實驗室主要以病毒及細菌的鑒定和分類為主，實驗室涉及1~4類病毒（菌），危害比較大，這種危害包括了對人的危害、對環境的危害，同事包括了對實驗對象的危害。所以，病原微生物實驗室應在特殊的實驗室生物安全實驗室中完成。

（2）衛生微生物實驗室

  衛生微生物實驗室主要以產品監測和檢測為主，危害較小或無危害，實驗室對象主要以食物、化妝品、空氣和水等，重點注意的是環境對樣品或樣品之間的污染，所以衛生微生物實驗室主要在潔凈實驗室中完成。

三、物理實驗室

  物理實驗室包括電學實驗室、熱學實驗室、力學實驗室、光學實驗室、綜合物理實驗室等。